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科学家仔细研究了基因组

时间:2020-09-18 20:10:59 来源:互联网

生物医学技术的突破性进展已经走了很长一段路,特别是在基因组结构的三维映射方面。多年来,科学家和研究人员一直试图获取和分析生物体DNA的整个3D结构,以观察和了解其复杂的组织以及基因如何起作用和相互作用。

现在,通过将尖端的计算机科学技术与领先的生物医学技术相结合,计算机科学家和生物信息学研究人员郑望准备帮助研究人员以超分辨率3D形式查看基因组的各个方面(几乎不可能通过显微镜观察)以更好地解释它的生物学意义。

Wang专门从事生物信息学研究这一跨学科领域,将生物学,统计学和计算机科学相结合,最近获得了一项为期五年,价值182万美元的“最大化研究者研究奖”(MIRA),该奖被认为是美国国立卫生研究院最有名望的一笔赠款杰出的研究人员,以开发更复杂的计算算法,从而可以更仔细地观察3D基因组。

“这是一个非常令人振奋的消息,”王说。“该奖项将帮助我为研究基因组开发新的3D视角。在接下来的五年中,我希望开发计算算法来重建单细胞的3D基因组结构,并建立深度学习算法以增强所谓的Hi-C的分辨率,Hi-C是用于检测人体不同部位之间空间接近性的生物化学实验。基因组。”

尽管Wang是该奖项的唯一首席调查员,但他说如果没有合作者,他将无法完成自己的工作。他已经获得了米勒医学院神经科学家Vance Lemmon和John Bixby的帮助。他们的实验室正在提供小鼠基因组样本,以帮助Wang检查受损神经元细胞再生过程中3D基因组结构的变化。

这位科学家还正在使用其他生物化学实验室产生的Hi-C数据,这些实验室使用人脑,肝脏,脾脏,胃和癌细胞。“无论是计算机程序还是Hi-C实验都无法直接检测3D基因组结构。但是生化湿实验室可以提供细胞或Hi-C数据,这将使我能够创建智能算法来构建3D基因组结构,然后非常非常紧密地进行分析。”

该奖项还将帮助王回答有关基因组结构如何影响基因调控和细胞其他重要生物学过程的科学问题,以及长非编码RNA在基因组结构形成中的作用。

Wang说:“令我着迷的科学问题是,为什么3D基因组结构不同,以及这些差异将导致什么后果,” “有了这个奖项,我希望回答研究基因组时可以使用的基本和生物学问题。我的目标之一是帮助其他科学家开展进一步的研究,以便他们可以更深入地研究基因组并能够研究特定的疾病。”

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